
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物体 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研发但是
科学研究考生科学探究因为保鲜用时段加长羊肉的密度、持水、金属光泽度、分散铁分子量、ROS、脂质过脱色物、MDA、GSH和GPX4技术来分析肌肉团体团体受损神经细胞的铁窒息死亡情形。結果体现,保鲜用时段加长后,羊肉的密度在第8天和第6天有明显下跌;持水业务能力拉低;顏色变深,丢失金属光泽,鲜大蓝色成为暗大蓝色。于此,分散铁、可溶性氧和MDA的分子量有明显增高,受损神经细胞凋亡率有明显增大。 研发人群拆分相互影响速冻一时期的肌肤供试品的球脂肪酸,第三实施SDS-PAGE分享,球脂肪酸条带在相互影响一时期划分一致且差不多(图1a)。会根据球核核蛋白酶在相互影响供试品中的传达条件,分享发掘同时个组供试品的中四位数类似于同时个层次(图1b),介绍肌肤供试品球脂肪酸体现了充分的组内差不多性和组间相互影响性。 淀粉酶质组学共鉴别出1996种淀粉酶质。以B0为照表组,淘汰B1、B2、B4和B6中的淀粉酶通过区别表现解析一下,共鉴别到376个DEPs。将火山图多维解析,并按照其FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两个标准的解析一下DEP。报告右图1c-f下图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别鉴别出22、33、73和140个DEPs,中间分头别上涨6、11、32和83个,调低16、22、41和5两个。聚类分析法办法测评了区别保温第一阶段健身肌组识中淀粉酶质的表现,报告体现健身肌淀粉酶表现区别发生变化存储日子的扩大而扩大(图1g)。
图1| 各个保鲜时期的力量样品英文球氨基酸组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一样冷冻箱周期的全身肌肉样板不同之处淀粉酶阐述(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁枯死蛋白酶肽的PRM按量定性分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 体系结构KEGG含有距离表达爱蛋白质的铁枯死体系(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱菌物提供了TMT降钙素原检测蛋清质组学系统业务,拜谱海洋生物已研发部门顺利完成并设立了改进完美的转录组学、蛋清组学、基础代谢组学以其两组学合拜谱生物牌系统业务安全体系,欢迎致电咨询!
参考价值专著:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.