
2024年9月由东莞畜牧业综合大学张万刚客座教授人员在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱怪物为该研究提供了亚硝基化修饰语组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文字幕主题词:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
学术期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202多年引响指数公式:5.7
发表过时:2024年9月
企业院校:南京农业大学
研发产品:蛋白
拜谱保证技巧:亚硝基化修饰组学
技术设备路线规划:
一、科研毕竟
01.Caspase-3活力
现下尚不知道NO对caspase-3的仰制作而成用能不能归因于NO介导的S-亚硝基化,有所差异质量浓度梯度方向的GSNO身为外源性NO生产,以引发caspase-3的身体S-亚硝基化。没想到揭示,与都没有GSNO的组不同之处,100、200和400μM GSNO组的caspase-3灵化学活化相关性下降(图1),与事先报到相符。GSNO加工处理下降caspase-3灵化学活化的存在现象仍进一步阐释。
图1 与众不同质量浓度的GSNO正确处理对caspase-3可溶性的影向
02.Caspase-3的S-亚硝基化程度较
钻研Caspase-3的亚硝基化状态,以阐发GSNO对Caspase-3的作用性。经GSNO正确处理后,检验到caspase-3蛋清S-亚硝基化密度加强(图2)。某些结果显示呈现,外源性GSNO训练可非常成功引导caspase-3的身体之外S-亚硝基化。最令惊愕的是,在如果没有GSNO长期存在的差表组中检验到是一个绚烂的S-亚硝基化带,这呈现caspase-3很有可能发生的内源性的S-亚硝基化。与此同时,本钻研中caspase-3的S-亚硝基化状态较高,而caspase-3的化学活化较低,这与以前的钻研相一致。以至于,caspase-3的特男人S-亚硝基化遮盖位点尚不明白,还要有进一歩的经历。
图2 GSNO处置对caspase-3S-亚硝基化水准的导致
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化装饰组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的编码回文序列。天蓝色箭头的编码回文序列标识S-亚硝基化肽,橙红色箭头的C标识S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3可降解结血清
结核球蛋清质最为1种必要的神经肿瘤细胞骨架核球蛋清质,在提升肌神经肿瘤细胞组成部分的组成部分详细完好性和缩水性领域起着必要效果,探讨S-亚硝基化caspase-3对结核球蛋清质化学化学降解的敏感脆弱性兼具必要价值。与Std(未用胱天核球蛋清质酶-3和GSNO孵育的初使肌钎维核球蛋清质)组比起,0 μM GSNO组(肌原钎维和caspase-3的孵育,无GSNO)的详细全面结核球蛋清质水分含碳量重要拉低,显示caspase-3对结核球蛋清质兼具隐藏的的核球蛋清质电离力量。在GSNO孵育后,详细全面结核球蛋清质的水分含碳量非常明显扩大(P < 0.05)。与此同时,当GSNO浓度值提升时,详细全面结核球蛋清质的水分含碳量连续调涨(P < 0.05)(图5)。上述找到表达,SNO表达的caspase-3以品质根据的的方式抑止结核球蛋清质的化学化学降解。
图5.S-亚硝基化caspase-3化学降解结核蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3光降解肌钙淀粉酶-T
肌钙核核淀粉酶-T (TnT)是原肌球核核淀粉酶调承担腹肌做收缩的丝条的必须肌原玻璃纤维棉棉核核淀粉酶。TnT的可挥发塑料功能是查测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化前提条件下,caspase-3对TnT的可挥发塑料环境如图已知6一样,与Std组(会含caspase-3和GSNO的肌原玻璃纤维棉棉)相较,caspase-3组中30 kDa TnT精彩片断可观加剧,体现了caspase-3参与者了TnT的可挥发塑料,不但,caspase-3与GSNO的孵育会造成30 kDa TnT上升。在100和200 μM GSNO组中间未查测到很明显的的差异(P > 0.05),而当GSNO的浓度值起到400 μM 时,该精彩片断可观缩短(P < 0.05)。此类挖掘体现了了SNO绘制的caspase-3对TnT可挥发塑料的促使用途。结核核淀粉酶和TnT是caspase-3的的敏感底物,而GSNO正确处理下降caspase-3的几丁质酶也许会造成肌原玻璃纤维棉棉核核淀粉酶可挥发塑料度下降。笔者认为所写,NO引诱的S-亚硝基化应该经过绘制半胱氨酸残基来调caspase-3的几丁质酶,因而进几步作用其对结核核淀粉酶和TnT的核核淀粉酶油脂水解能力素质,所以作用鸡肉的品质。
图6. S-亚硝基化caspase- 3可降解肌钙淀粉酶-T
二、个人总结
本分析旨在通过探究S-亚硝基化对caspase-3呈现的决定以至于之后对羊肉肌原食物棉纤维体内降解塑料的决定。核核蛋白酶S-亚硝基化能够 呈现caspase-3的半胱氨酸残基,因此影响caspase-3抗逆性大大减少,进第一步治理和改善了其对羊肉肌原食物棉纤维核核蛋白酶的核核蛋白酶水解反应技能。三、拜谱总结ppt
论述采取了酶活判断,亚硝基化绘制组学阐述,WB等检侧技术,发现了血清S-亚硝基化也可以绘制caspase-3的半胱氨酸残基,这从而导致了caspase-3亲水性的减轻,并举两步阻止了其对牛羊肉肌原黏胶纤维血清的血清油脂水解学习能力。本论述为释疑血清质亚硝基化对肉嫩的调节考核机制出示好几个个新的的视角。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的蛋清质组学、呈现蛋清质组学、细胞代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系列类产品类产品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺碱化、total脱色替换、散布巯基,欢迎大家咨询!
参阅医学文献:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663