
近日,合肥医学院考研首要加盟门诊王学浩中科院院士队伍在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向疗法能量是什么分解检测分析服务。
因为名称:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文翻译网站标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
业主行业:南京医科大学
科研原料:细胞
拜谱提拱安全服务:转录组测序+淀粉酶互作组+靶向药物精力排泄组
方法路经:
学习的结果
01、YBX1被检验为HCC中糖酵解的重要性人类基因
本理论研究收集HCC恶性肺部淋巴肿癌样板(n=7)的单細胞RNA测序统计统计数据集来浅析,出现 糖酵解渗透性具体集中在在恶性肺部淋巴肿癌細胞中,hdWGCNA浅析区分出9个染色体传感器(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的荒岛繁衍浅析确认YBX1为独立的荒岛繁衍问题要素(图1H)。进十步融入IHC、WB工作和恶性肺部淋巴肿癌公司与领近非恶性肺部淋巴肿癌公司的余地转录组学统计统计数据集验证YBX1是肝細胞癌治疗方法的潜在性的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被判定为自动调节HCC神经细胞糖酵解的核心环境因素
02、YBX1加速HCC中的有氧糖酵解和增值
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点卡路里分解代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1增进HCC中的有氧糖酵解和繁殖
03、OGT与YBX1综合并增进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1结合实际并力促YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化强化其磷过酸,导致促使其核转位
进的每一步判断YBX1的O-GlcNAc糖基化能不会影响其磷碱化,在OGT敲低的HCC神经元中或用OGT遏药物制剂OSMI-1正确治理 ,YBX1球血清质量有效消减,YBX1磷碱化有效少(图4A-C)。IP实验操作提示 ,在相似的Flag-YBX1底物质量下,YBX1-WT的磷碱化质量有效低于YBX1-T57A,揭示磷碱化的延长除了仅是担心越来越高的YBX1球血清呈现(图4D)。离心分离了核和质多组分发掘TMG正确治理 的HCC神经元中YBX1核呈现的增高(图4E-F),进的每一步发掘YBX1磷碱化的重要性调整指数是AKT(图4G-I)。一些发掘推崇O-GlcNAc糖基化根据使得其磷碱化来资料YBX1球血清增强性并使得核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 淡化有立于于其进每一步情况磷酸性反应淡化并就可以利于其核转位
05、YBX1利于PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1催进PKM2转录
06、YBX1 就可以加快组蛋清乳过酸呈现含量
分析会发现YBX1敲低可观降底球氨基酸乳硝化为用,更是是H3K18乳硝化为用(图6A-C)。糖酵解阻止剂2-DG的实验所验证了糖酵解与组球淀粉酶乳硝化为用的随便微信关联,阻止糖酵解可可观降底H3K18la水准(图6D)。PKM2过表明可逆性转YBX1敲低所至的H3K18la减退,到外源乳酸治理这不仅上升H3K18la,还引发YBX1表明调涨,提醒来源于正向着上报(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR验证,H3K18la可以通过聚集于YBX1开机子随便提高其转录,该工作受O-GlcNAc糖基化干预(图6H-J),并会发现P300 调涨是YBX1激发H3K18乳酰化为用的管理机制(图6K-L)。
图6.YBX1强化H3K18乳碱化装饰水准
优秀文章总结
在一项论述中有关报道了YBX1在HCC中高表答,和与糖酵解谜切有关的。YBX1在T57处被O-GlcNAc淡化,最终得以稳固淀粉酶质并扩大其表答。种淡化还可以淡化YBX1在T57处的磷硝化作用,可以淡化其核易位。因而,这一项的过程 激发了糖酵解有关的DNA遗传的转录并刺激性乳酸的行成。不仅,YBX1成功激活P300的转录,接着能够组淀粉酶的乳硝化作用,特别的是H3K18la,H3K18乳硝化作用双向宏观调控YBX1DNA遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观基因遗传规律正反面馈环缘由图
拜谱总结ppt
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱海洋生物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向疗法力量新陈代谢组技术服务,拜谱生物学建立了完善成熟的转录组学、血清组学、反译后掩盖组学、分泌组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
对比毕业论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.