草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿体系通种类的疫情之五。肾组织结构中CaOx氯化钠晶体过饱和积聚会致使肾小管组织直接损伤和凋亡，才能致使肾结石的达成。短链脂肪细胞堆积酸由肠内内好氧菌细菌病毒进行发酵膳食结构食物纤维发生，不单单在线条肠内防线中推动用，有时在体系技术上也推动重要性用。至少，丁酸是最多的短链脂肪细胞堆积酸，更具消除炎症和免役仰制用,本研究方案初探丁酸对CaOx肾结石的用十分不确定性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山大医院泌尿产科吴忠博士研究生生导师、周子健博士研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教导、周子健硕士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱怪物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了数据网络临床药理学精准服务，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

新闻稿件明称：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 玩家公司：华山医院专家 探究另一半：大鼠、HK-2组织细胞 好友分组资料：比对组（Con）、模形组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱作为工艺：网站药剂学学加测

想法流量图

研究方案后果

论述员先要搭建大鼠型号，用生理方面血生化依据和团队病症学固色等论述具体方法察觉丁酸都可以减低CaOx型号大鼠肾CaOx结晶的达成和问题，促进CaOx型号大鼠的疾病问题和腐蚀化合物的导致过度表示。前者，丁酸还可可以抑制草酸诱发的HK-2体内部问题、腐蚀应激性和体内部凋亡。 为洞察具体定性深入分析一下丁酸节构和靶遗传dna微信互联网信息，的研究相应的人员从PubChem获取一个丁酸和丁酸酯的二维和立体节构（图1A）。依据PharmMapper的db2参数库和Uniprot的db2参数库办理后共挑选出114个丁酸靶遗传dna供进这一步具体定性深入分析。将遗传dna下拉列表加入STRING的db2参数库，去PPI微信互联网信息具体定性深入分析。Cytoscape提供了排列顺序的前20的联络线靶遗传dna的详细深入分析微信互联网信息图，涵盖CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。以下联络线遗传dna与微信互联网信息中的某个遗传dna均必要表现出一定程度的相应的性，介绍以下遗传dna有机会起到着联合能力。GO和KEGG具体定性深入分析体现了了丁酸联络线遗传dna的相应的途经和动物学效果（图1C）。联络线遗传dna必要与类固醇肾上腺素回应、空气脱色应激响应不起效果回应、亲水性氧神经细胞对类固醇肾上腺素敏感的不起效果并且 对偏酸催化材质的不起效果相关联。上面说明，以下联络线遗传dna必要进行了空气脱色应激响应不起效果和对亲水性氧的动物不起效果方式，是肾结石确立管理机制中至关必要的途经，这显示丁酸有机会在肾结石中起到必要能力。

图1| 丁酸空间结构与靶人类基因wifi网络了解(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一大步挑战丁酸对CaOx肾结石真的切靶染色体，学习成员利于GEO的数据信息库对GSE73680中安全健康對照与CaOx肾结石患病者的染色体的差异实现了学习。對照组与CaOx结石患病者的可观性的差异描述染色体（DEGs）塞查原则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个染色体突发可观变化无常，其中的3379个（89.4%）染色体描述上浮，404个（10.6%）染色体描述上涨（图2A）。对DEGs实现聚类算法算法开始分析，热图显示信息了前10个被选中DEGs的二维分类聚类算法算法结构特征（图2B）。马上又，学习成员经由GeneCards的数据信息库工人判定了370个可能会与CaOx肾结石有关系的染色体，排在前20位的预测分析染色体试述有关系性评价如图一样2C一样。关键的在于找自己丁酸开始治疗CaOx肾结石的关键的靶点，学习成员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关系染色体处置赢得半个个Venn图。结果，CYP2C9被判断为丁酸引响CaOx肾结石的自身靶点(图2D)。不但，学习成员还实现了丁酸与CYP2C9的碳原子交接，CYP2C9的八个氨基酸等残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸相护反应，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在利用网上临床药理学估计CYP2C9是丁酸干扰CaOx肾结石的靶dna后，钻研人数还完成生殖组织工作声明了CYP2C9可降低了草酸介导的HK-2生殖组织的ROS含量、支原体感染受伤和凋亡。

图2| 部分据库结合探讨預测CYP2C9是丁酸反应于CaOx肾结石的靶表观遗传

调查但是

本实验英文先察觉到丁酸在离体和身体内部均能可遏制CaOx肾结石模式化的脱色应激性反应和支原体感染病变神经神经问题，之后实现系统药剂学学需求得见丁酸决定CaOx肾结石的潜在性的靶点——CYP2C9，之后实现神经细胞核实验英文查证CYP2C9在草酸盐帮助的HK-2神经细胞核ROS关卡、支原体感染病变神经神经问题和凋亡。这种察觉到揭示丁酸也许 实现可遏制CYP2C9来可遏制CaOx肾结石的脱色应激性反应，减弱支原体感染病变神经神经问题。这类全过程中拜谱生物工程体保证了系统药剂学学技巧服務，然而拜谱生物工程体可增长稳定成熟的遗传基因组学、淀粉酶质组学、分解代谢组学等两组学产品设备及技巧服務，青睐转达详询！ 可以参考文章：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.