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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T上皮上皮細胞能快速精确肿癌上皮上皮細胞面上的一般公司混溶性和好体(MHC)呈递的抗原而触及抗体结构性反映。MHC I类(MHC-I)团伙与CD8+ T上皮上皮細胞充分效果,其呈递的肽一般来源地于内源性胞质淀粉酶质的淀粉酶质酶体吸附塑料,而MHC II类(MHC-II)团伙一般抒发于专科抗原提呈上皮上皮細胞,与CD4+ T上皮上皮細胞充分效果,其呈递的肽发源使用内体渠道吸附塑料的胞外和胞内淀粉酶质(图1)。对此,快速精确由MHC团伙呈递的肿癌抗原这对设计依懒T上皮上皮細胞快速精确和干掉肿癌上皮上皮細胞的行之有效和安全卫生的淋巴肿瘤抗体结构性物理疗法是至关必要的。系统设计质谱(MS)的抗体结构性肽组学(Immunopeptidomics)能从各种上皮上皮細胞系、肿癌公司和正常公司中高通骁龙量、间接监定MHC通过肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC表面抗原丰度MHC及紧密结合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫抗体肽编码序列与翻意后修饰语讯息,提高基因测序的真实度,并采用De novo重新测序技術,不依赖现有数据库,极高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且极为丰富的统计数据进行分析项目为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递肺部肿瘤抗原的路径

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

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情况定量分析

01 规则研究方案

内容题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

发表文章期刊杂志:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)是种核工作输出球蛋白,在肺癌中一般过体现,做以为肿癌发生的的驱动安装影响因素。近年来,靶向治疗XPO1的小分子结构正被重复使用临床医学治癌用量。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫系统肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 1种来自XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 肺部肿瘤-免疫细胞调理

一篇文章题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

收录杂志期刊:Nature Communications IF:16.6 2023

恶意胸膜间皮瘤(MPM)不是种生存率欠佳的入侵性癌肿。根据当下的疗法细则缺泛药效,所以说迫在眉睫须得新的疗法战略。由于其T人体细胞侵润,我有效市场理论MPM不是个最合适的疗法性肠癌狂犬疫苗的计划。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用根据质谱的天然免疫肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 梭形细胞肿瘤胸膜间皮瘤免役肽组学查重

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 大肠杆菌mRNA防疫针联合开发

一篇文章选择题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

投稿月刊:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过源于质谱的免疫抗体肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌细菌感染的Hela生殖受损细胞和HCT-116生殖受损细胞中亲子鉴定MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱总结ppt

免疫血细胞力性体神经生殖血细胞体神经生殖血细胞整体检测肽组学是蛋清质组学的1个更快的发展壮大的派系,它用心打造于探究免疫血细胞力性体神经生殖血细胞体神经生殖血细胞整体检测整体中由核心结构相溶性复合材料体(MHC)或人类白体体神经生殖血细胞抗原(HLA)原子核呈递的免疫血细胞力性体神经生殖血细胞体神经生殖血细胞整体检测肽。某些免疫血细胞力性体神经生殖血细胞体神经生殖血细胞整体检测肽是体体神经生殖血细胞外表呈递的肽段,才可以被T体体神经生殖血细胞判断,最终得以勾起免疫血细胞力性体神经生殖血细胞体神经生殖血细胞整体检测反应迟钝。体系结构质谱的免疫血细胞力性体神经生殖血细胞体神经生殖血细胞整体检测肽组学都已经 成监定MHC蛋清呈递肽的金标准规范做法,才可以之间监定不同的于顺利和病症方式下不同的于结构和体体神经生殖血细胞品类中的免疫血细胞力性体神经生殖血细胞体神经生殖血细胞整体检测肽组,列举三维线瘤或木马影响的体体神经生殖血细胞。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的球蛋白组学、分解代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫力肽组加测精准服务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,能够较准且会直接供给免役肽回文序列,显示比较多非关键免役肽,层层抓落实建立出正规新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

参考资料专著

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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